Jola Škulj raziskuje teoretske in metodološke aspekte literature ter literarno zgodovino 20. st. v primerjalni perspektivi. Po študiju slavistike in anglistike je vpisala še primerjalno literarno vedo in literarno teorijo (diploma 1980, magisterij 1991) ter svoja metodološka izhodišča že pred zaključkom študija preverjala v konsultacijah z uglednimi mednarodnimi imeni (David Lodge, Birmingham University; John Fletcher, Malcolm Bradbury, Roger Fowler, University of East Anglia, Norwich), na ameriški poletni šoli v Salzburgu (1977) ter na komparativističnih kongresih (Budimpešta 1976, Innsbruck 1979). V svojem razvejanem interesu je (so)organizirala več strokovnih srečanj in konferenc, nekatere z mednarodno udeležbo (o postmodernizmu, poststrukturalizmu ter dekonstrukciji, Bahtinu in humanistiki, literaturi in prostoru/ prostorih transgresije). Uredila je nekaj knjižnih izdaj; je član uredniškega odbora Primerjalne književnosti. - Povabljena je bila v mednarodne raziskovalne projekte: 1990-1992 o kulturni identiteti in politikah angleščine (v koordinaciji Birkbeck College, University of London), 2002-2005 v ACUME o kulturnem spominu evropskih dežel (v koordinaciji Univerze iz Bologne) in za obdobje 2006-2009 v program ACUME 2 o sprepletenosti znanosti, literature in humanistike. V inštitutskem bilateralnem projektu z Masarykovo univerzo iz Brna (2003-2005) o metodoloških problemih primerjalne literarne vede z vidika češko-slovenskih odnosov je sodelovala z razdelavo modernizma in semiosfere. - V slovenskem Društvu za primerjalno književnost (SDPK) je aktivna od njegovih začetkov, več let vodila tajniške (1985-1997) in predsedniške posle (1997-2002). Je članica mednarodne zveze za primerjalno literaturo (AICL/ICLA), 2003 je bila izvoljena v regionalni raziskovalni odbor ICLA za V in JV Evropo; 2004 pa je postala še član izvršilnega odbora AILC/ICLA. - Bila je med ustanovnimi člani Evropske mreže za primerjalne študije (REELC/ENCLS), maja 2003 imenovana v izvršilni odbor, 2005 pa ponovno izvoljena. - V okviru tekočih inštitutskih raziskav o elektronskih edicijah literarnih virov trenutno preučuje temo o dinamični avtentičnosti tekstov v e-arhivih ter vidike digitaliziranih kulturnih virov v komparativistiki.